Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM16LQ309B1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms