Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms