Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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PTPROQ16827 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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PTPROQ16827 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
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PTPROQ16827 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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PTPROQ16827 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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PTPROQ16827 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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PTPROQ16827 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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PTPROQ16827 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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PTPROQ16827 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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PTPROQ16827 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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PTPROQ16827 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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PTPROQ16827 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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