Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SGCAQ16586 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SGCAQ16586 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SGCAQ16586 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SGCAQ16586 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SGCAQ16586 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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