Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPE65Q16518 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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