Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIK5Q16478 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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