Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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EFNB3Q15768 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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EFNB3Q15768 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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EFNB3Q15768 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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EFNB3Q15768 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EFNB3Q15768 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB3Q15768 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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