Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNHIT3Q15649 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNHIT3Q15649 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms