Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP10Q15642 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms