Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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SS18Q15532 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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SS18Q15532 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SS18Q15532 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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SS18Q15532 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SS18Q15532 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SS18Q15532 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SS18Q15532 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SS18Q15532 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SS18Q15532 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SS18Q15532 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SS18Q15532 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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