Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms