Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BECN1Q14457 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms