Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGB1Q14028 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGB1Q14028 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms