Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ATRQ13535 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATRQ13535 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATRQ13535 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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