Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BFSP2Q13515 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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BFSP2Q13515 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BFSP2Q13515 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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