Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIK2Q13002 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
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