Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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NFIAQ12857 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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NFIAQ12857 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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NFIAQ12857 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NFIAQ12857 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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