Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
STX4Q12846 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
STX4Q12846 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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