Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CGNL1Q0VF96 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms