Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPAL4Q0D2K0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms