Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms