Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAD51Q06609 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAD51Q06609 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms