Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPAQ06546 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GABPAQ06546 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms