Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms