Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CYP27A1Q02318 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CYP27A1Q02318 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms