Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HSF1Q00613 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms