Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOMO3P69849 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOMO3P69849 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOMO3P69849 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOMO3P69849 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOMO3P69849 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOMO3P69849 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOMO3P69849 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOMO3P69849 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOMO3P69849 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NOMO3P69849 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NOMO3P69849 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms