Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HBBP68871 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HBBP68871 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HBBP68871 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms