Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACTBP60709 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ACTBP60709 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ACTBP60709 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ACTBP60709 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ACTBP60709 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ACTBP60709 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACTBP60709 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACTBP60709 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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