Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCBP3P57721 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCBP3P57721 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms