Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAG2P55895 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAG2P55895 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAG2P55895 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAG2P55895 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAG2P55895 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAG2P55895 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAG2P55895 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAG2P55895 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAG2P55895 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAG2P55895 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAG2P55895 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAG2P55895 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAG2P55895 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAG2P55895 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms