Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP7P55210 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP7P55210 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP7P55210 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP7P55210 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP7P55210 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP7P55210 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP7P55210 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms