Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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RAB5CP51148 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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RAB5CP51148 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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RAB5CP51148 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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RAB5CP51148 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5CP51148 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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