Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERFP50548 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERFP50548 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERFP50548 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERFP50548 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERFP50548 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERFP50548 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERFP50548 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERFP50548 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERFP50548 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERFP50548 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERFP50548 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERFP50548 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERFP50548 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERFP50548 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERFP50548 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERFP50548 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERFP50548 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERFP50548 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERFP50548 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ERFP50548 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERFP50548 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERFP50548 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERFP50548 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms