Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TAF6P49848 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF6P49848 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF6P49848 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF6P49848 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms