Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD97P48960 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD97P48960 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD97P48960 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD97P48960 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms