Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTDSS1P48651 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms