Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZEB1P37275 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms