Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPS1P31327 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPS1P31327 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPS1P31327 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPS1P31327 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPS1P31327 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPS1P31327 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPS1P31327 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPS1P31327 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPS1P31327 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPS1P31327 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPS1P31327 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPS1P31327 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPS1P31327 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPS1P31327 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPS1P31327 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPS1P31327 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPS1P31327 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPS1P31327 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPS1P31327 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPS1P31327 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPS1P31327 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPS1P31327 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms