Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA1P25391 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMA1P25391 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMA1P25391 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMA1P25391 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMA1P25391 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMA1P25391 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMA1P25391 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMA1P25391 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMA1P25391 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms