Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CREB1P16220 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms