Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COX6A1P12074 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COX6A1P12074 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms