Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A1P11836 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A1P11836 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms