Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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