Protein–RNA interactions for Protein: O75976

CPD, Carboxypeptidase D, humanhuman

Predictions only

Length 1,380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPDO75976 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPDO75976 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPDO75976 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPDO75976 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPDO75976 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPDO75976 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPDO75976 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPDO75976 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPDO75976 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPDO75976 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPDO75976 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPDO75976 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPDO75976 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPDO75976 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPDO75976 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPDO75976 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPDO75976 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPDO75976 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPDO75976 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPDO75976 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPDO75976 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPDO75976 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPDO75976 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPDO75976 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPDO75976 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPDO75976 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPDO75976 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPDO75976 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPDO75976 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPDO75976 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPDO75976 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPDO75976 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPDO75976 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPDO75976 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPDO75976 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPDO75976 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms