Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms