Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRODHO43272 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRODHO43272 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRODHO43272 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRODHO43272 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms