Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP290O15078 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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CEP290O15078 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP290O15078 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP290O15078 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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CEP290O15078 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP290O15078 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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CEP290O15078 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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CEP290O15078 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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CEP290O15078 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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CEP290O15078 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP290O15078 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP290O15078 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP290O15078 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP290O15078 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP290O15078 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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