Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APAF1O14727 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APAF1O14727 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
APAF1O14727 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
APAF1O14727 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
APAF1O14727 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms