Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRPO00591 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRPO00591 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRPO00591 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRPO00591 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRPO00591 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRPO00591 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRPO00591 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRPO00591 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRPO00591 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRPO00591 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRPO00591 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRPO00591 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRPO00591 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRPO00591 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRPO00591 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRPO00591 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRPO00591 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRPO00591 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRPO00591 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRPO00591 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRPO00591 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRPO00591 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRPO00591 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRPO00591 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRPO00591 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRPO00591 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRPO00591 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms